不過隨著清同治十年的一場大水，不單淹沒了鹿耳門媽祖信仰中心的鹿耳門媽祖廟，也讓本來媽祖廟裡的神像器具四處飄散，而形成了如今鹿耳門一帶有著兩間媽祖廟互爭奪自己才是最早、最正統媽祖廟的特殊局面。
那如今再次在矗立在鹿耳門的媽祖廟，到底是誰才是真正的開基媽祖廟呢？
詢問了不少台南當地的朋友，也看了些學術方面的田野調查與裨官野史，小編就要帶大家來解謎了！
故事是這樣開始的，鹿耳門媽祖廟被洪水沖垮之後，寺廟內部的神像器具等，分作三路：開基媽祖神像、古鹿耳門媽祖廟金爐、其他大型器具及神像，散落各處。
第一路：開基媽祖神像被信徒冒水請出寺廟，最後輾轉落在現今的鹿耳門天后宮爐主家中，祀奉著等待新的媽祖廟建立起來。
第二路：其他不方便搬運的大型神像其器具，則是經由水路運到了臨近的水仙宮作為安置。原本以為可以等到新的媽祖廟建成後，一併請回，豈知，時至日治時期，新媽祖廟一磚一瓦都還沒個影子，水仙宮就被日本政府東拆西挖，拿去蓋防空設施。
無計可施之下，只好又把本來安置在水仙宮的神像又遷移到了安海宮安置祭祀，沒想到就這樣一路拖到了台灣光復，新媽祖廟卻遲遲不見興建。
那第三路金爐到哪去了？
台灣光復後，附近一座最大的村莊，眼見新媽祖廟始終不見蹤影，於是帶著在水災中拾獲的鹿耳門媽祖廟金爐，將安置在安海宮的神像、器具們請回了村莊的保安宮裡，並改名聖母廟主祀媽祖。
但保安宮原本可不是座空廟啊！擅自將保安宮改為聖母廟，使得原本主祀的五府千歲遭到冷落，事情可不是這麼好解決的。
聽當地耆老傳說，此項決定得罪了五府千歲，而讓村莊不太平順了一陣子，可造就了另一段鄉野奇談。
如果事情發展到這便塵埃落定，那也罷了，偏偏迎回了眾多神像的聖母廟。獨漏了最重要的一尊：開基媽祖金身。
不甘示弱的當地居民只好依樣化葫蘆，在原先較接近舊有鹿耳門媽祖廟的地方蓋起了天后宮，並將媽祖金身迎回寺內供奉。
兩間都有部分古鹿耳門媽祖廟文物的宏偉廟宇，就此開始為了誰才是真正與鄭成功上岸有關係的古鹿耳門媽祖廟後繼者爭論不休，不單一度讓村莊間嚴重不和，甚至在台南要設置鄭成功上路紀念碑時，把爭端搞的全國皆知。
不過踏過寬廣廟的廟埕進到華麗又莊嚴的寺內，捻住清香像媽祖祈求平安健康，抱著心誠則靈的念頭，誰是正統，是乎也好像不是這麼重要的一件事了？
（本文獲「時刻旅行」授權轉載，原文刊載於此）
